21. gadsimtā Eiropa saskaras ar daudziem izaicinājumiem, ko rada globālā sasilšana, piesārņojums un citas ar vidi saistītas problēmas. Baltijas valstīs Rail Baltica palīdzēs samazināt cilvēku mobilitātes radīto ekoloģisko pēdas nospiedumu. Dzelzceļš ir vienīgais transporta veids, kas nav pilnībā atkarīgs vienīgi no fosilās degvielas un tā Eiropas transporta enerģijas patēriņš starp citiem transporta veidiem ir mazāks par 2 %, kaut arī tā tirgus daļa ir lielākā par 8,5 %. Turklāt, rosinot daļēju transporta veidu pārnesi no autoceļiem uz dzelzceļu – te ir runa par kravu un pasažieru plūsmu – pateicoties mērogu ekonomijai, Rail Baltica veicinās klimata izmaiņu rezultātā veidojošos monetāro efektu samazināšanu, kā arī samazinās autoceļu uzturēšanas izmaksas un trokšņa radīto piesārņojumu.
